8:30
|
Lenka
Filipiaková
|
B3
|
Ing. Marie Švecová
|
Využití SERS a SEIRA spektroskopie pro detekci myricetínu
|
detail
Využití SERS a SEIRA spektroskopie pro detekci myricetínu
Myricetín je prírodný flavonoid s antioxidačnými vlastnosťami, ktorý pomáha v prevencii pred niektorými druhmi rakoviny, karcinogénnymi mutáciami či kardiovaskulárnymi ochoreniami. Bežne sa vyskytuje v brusniciach, goji či čiernych ríbezliach. Za špecifických podmienok má naopak aj nežiadúce účinky ako mutagénnosť alebo degradáciu DNA po ich vzájomnej interakcii. Myricetín se vyskytuje vo svojom prirodzenom prostredí v nízkych koncentráciách, ktoré môžeme sledovať napr. technikami povrchom zosílené vibračné spektroskopie (SEVS - Surface‑Enhanced Vibrational spectrocopy) vďaka zosilneniu optické odozvy v dôsledku interakcie analytu s plasmonickým kovom.
Hlavným cieľom tejto práce je vybrať správny typ zosilňujúceho substrátu (plazmonický kov, vhodná príprava povrchu, morfológia) a následne zvoliť vhodné experimentálne podmienky (predovšetkým vlnová dĺžka) pre identifikáciu myricetínu. Okrem moderných vibračných spektroskopii (SERS - Surface Enhanced Raman Scattering a SEIRA - Surface Enhanced Infrared Absorption), ktoré nám umožňujú preukázať samotný analyt, sú využité aj mikroskopické metódy (AFM - atomic force microscopy, SEM - scanning electron microscopy) k mapovaniu a získaniu informácii o morfológii povrchu.
|
8:50
|
Bc.
Eliška
Kantorová
|
M2
|
Ing. Milan Jakubek, Ph.D.
|
Aplikace pentametinů pro rozpoznání biologických významných aniontů
|
detail
Aplikace pentametinů pro rozpoznání biologických významných aniontů
Fluorescenční barviva jsou již dlouho předmětem zájmu v oblasti analytické chemie a biologie. Pro analytické aplikace v pokročilých zobrazovacích technikách (dvoufotonová či super rozlišená mikroskopie) jsou kladeny vyšší požadavky na fyzikálně-chemické vlastnosti těchto sloučenin. Dalším požadavkem je specifické intracelulární cílení (organely), které zůstává stále velkou výzvou. Kombinace těchto požadavků je aplikována v tzv. teranosticích. Práce se zabývá studiem vybraných cyklických derivátů pentamethiniových sloučenin pro možné využití v oblasti intracelulárních teranostik. V rámci práce byly provedeny spektroskopické experimenty s cílem studia chování látek a interakce s analyty v různě polárních rozpouštědlech. Pro studium byly zvoleny techniky fluorescenční a absorpční spektroskopie. Jako analyty byly vybrány biologicky aktivní látky například deriváty kyseliny cholové. Studované deriváty vykazovaly afinitu k biologicky aktivním iontům. Taktéž byly provedeny spektroskopické in vitro experimenty, které ukazují potenciál látek pro přípravu teranostik.
|
9:10
|
Bc.
Adéla
Koryťáková
|
M1
|
Ing. Marie Švecová
|
Příprava SERS substrátů galvanickou depozicí a jejich využití pro studium vybraných aminokyselin
|
detail
Příprava SERS substrátů galvanickou depozicí a jejich využití pro studium vybraných aminokyselin
Povrchem zesílená Ramanova spektroskopie (Surface-Enhanced Raman Scattering spectroscopy, SERS) je nedestruktivní technika, která se nejčastěji používá pro studium látek v malém až stopovém množství. Dochází zde ke znásobení optické odezvy analytů, jenž jsou adsorbovány na povrchu plasmonických nanostruktur kovu. Plasmonické vrstvy lze připravit např. elektrochemickými postupy a jednotlivé substráty umožňují rychlou a spolehlivou detekci širokého spektra látek.
Jednou z takových skupin látek jsou například aminokyseliny, jež jsou zajímavé jak z pohledu své rozmanité struktury, tak z pohledu své biologické významnosti. Aminokyseliny lze nalézt ve všech formách života na Zemi, běžně jsou uspořádané do větších útvarů – makromolekul, které se nazývají peptidy.
V této práci byly připraveny Ag, Au a Cu plasmonické substráty galvanickou depozicí na hliníkový povrch. Na takto připravené nosiče byly deponovány studované aminokyseliny (serin, cystein, histidin, tyrosin). SERS spektra byla měřena s využitím různých excitačních vlnových délek (785 a 1064 nm). Cílem této práce bylo nalezení vhodné kombinace plasmonického substrátu a excitační vlnové délky pro detekci a identifikaci vybraných aminokyselin.
|
9:30
|
Bc.
Karolína
Kubíčková
|
M2
|
doc. Ing. Bohumil Dolenský, Ph.D.
|
Využití kyseliny trifluoroctové ke zlepšení integrovatelnosti spekter NMR pro kvantitativní vyhodnocení
|
detail
Využití kyseliny trifluoroctové ke zlepšení integrovatelnosti spekter NMR pro kvantitativní vyhodnocení
Úspěšné provedení kvantitativní analýzy spekter NMR je závislé na řadě parametrů např. relaxační době jádra, rozsahu spektra, fázování spektra nebo integraci signálů. Posledně jmenovaným faktorem se zabývá tato práce. Častým problémem kvantitativní NMR (qNMR) je, že spektra studovaných látek jsou komplikována přítomností protonů podléhajících chemické výměně. Tyto signály jsou poměrně široké, a proto v mnoha případech zasahují do integrační oblasti ostatních signálů, čímž ovlivňují výsledek kvantitativní analýzy. Další z vlastností těchto protonů je, že jejich chemický posun je závislý na pH. Cílem této práce je zvýšit chemický posun signálů protonů podléhajících chemické výměně do oblasti, ve které nejsou signály studovaných látek. Pro tento účel byla využita změna pH roztoku sledované látky přídavkem kyseliny trifluoroctové (TFA) do kyvety. V této práci je navržený postup aplikován na modelové vzorky monohydrátu laktosy, mannitolu a prokain hydrochloridu.
|
9:50
|
Bc.
Věra
Schrenková
|
M2
|
prof. RNDr. Petr Bouř, CSc.
|
Raman Optical Activity of Nucleotides – Experimental and Theoretical Study
|
detail
Raman Optical Activity of Nucleotides – Experimental and Theoretical Study
Nucleotides are organic molecules composed of a purine or pyrimidine base, a five‑carbon sugar (deoxyribose or ribose), and one or more phosphoric acid residues. Uncondensed nucleotides may carry various biological functions as they can adopt a range of conformations in solution. It is advantageous to use polarized analogue of conventional Raman spectroscopy called Raman optical activity (ROA), because it provides unique stereochemical information. However, this information needs to be obtained through relatively complicated computer simulations. In the present work, experimental Raman and ROA spectra of adenosine, guanosine, deoxythymidine and cytidine 5'-monophosphate were interpreted using molecular dynamics (MD) coupled with density functional theory (DFT). MD itself provided precious information about the sugar puckering and other coordinates affecting the ROA signal of nucleotides. For example, the phosphate group strongly influences the sugar conformation due to the internal hydrogen-bond formation. The simulated spectra relatively faithfully reproduce most of the experimental features and may be thus used to determine or verify the conformation.
|
10:10
|
Kateřina
Veselá
|
M2
|
Ing. Milan Jakubek, Ph.D.
|
Studium interakce biologicky aktivních látek s ionty kovů
|
detail
Studium interakce biologicky aktivních látek s ionty kovů
Zvýšená koncentrace iontů přechodných kovů (např. mědi, zinku a železa) je spojena s řadou vážných patologií např. onkologických a neurodegenerativních onemocnění. Naše práce se zabývá studiem dusíkatých syntetických receptorů (strukturní motiv: tryptanthriny a prazoly) jako chelátorů iontů přechodných kovů ve vodných systémech. Strukturní motiv tryptanthrinů a prazolů je spojován s antimikrobiálními, protinádorovými a protizánětlivými účinky. V rámci práce byly studovány nově připravené deriváty tryptanthrinů (T8H-TSC, PAA-TSC) a již známe strukturní motivy prazolů (omeprazol, lansporazol, pantoprazol). Studované látky byly charakterizovány pomocí technik molekulové spektroskopie jako např. UV/Vis, NMR, IR, a Ramananovy spektroskopie. Následně byla provedena vazebná studie pomocí absorpční spektrometrie s ionty přechodných kovů a nukleovými kyselinami (DNA a RNA). Výsledky ukazují silnou afinitu v případě tryptanthrinů k měďnatým iontům a v případě prazolů k železitým iontům. Dosažené výsledky byly již z části publikovány v mezinárodním recenzovaném časopise s impakt faktorem.
|